1. Plano del plan de ampliación y reforma proyectado para el Paseo de Atocha, de La Ilustración Universal nº del 5 de abril de 1851, con indicación de la situación del embarcadero de Atocha. (1851 abril 5)*
2. Proyecto de asfaltado de vía novena de gran velocidad. - Incluye: Plano de situación, proyección horizontal, sección longitudinal por el eje de la vía y secciones transversales del proyecto de asfaltado de la vía 9ª. (1924 febrero 27)
3. Proyecto de nuevo carro transformador en gran velocidad. - Contiene: Presupuesto, extracto del plano general y croquis. (1925 noviembre 26)
4. Proyecto de mejoras en la nave central. - Incluye: Presupuesto. (1927 febrero 5/1927 marzo 10)
5. Proyecto de demolición y nueva construcción de las azoteas de Pacífico, nº 2. - Incluye: Plano. (1930 junio 18/1930 diciembre 5)
6. Proyecto de paso de asfalto desde el cocherón de llegadas G.V. al muelle nuevo de G.V. - Incluye: Plano de la ampliación de rampas de dos andenes para facilitar el tránsito de carretillas y establecimiento de un paso de losetas de cemento o asfaltado, desde el cocherón de llegadas de G.V. al muelle nuevo de G.V. (1930 octubre 7)
7. Propuesta del Concejal Delegado de Tráfico de abrir al tránsito público una calle que atraviese el jardín de la estación de Atocha para unir los patios de entrada y salida de viajeros para mejorar la circulación. - Incluye: Plano (63 x 84 cm)*. (1932 agosto 1/1932 septiembre 17)
8. Proyecto de muro de cierre inmediato al arroyo Carcabón. - Contiene: Plano de situación (Escala 1:1000), Plano de planta y alzado y Plano de detalles del muro (Escala 1:25). (1933 septiembre 30)
9. Ampliación y cambio de situación de la puerta que da acceso desde la Glorieta de Atocha al Servicio Sanitario. - Incluye: Planos. (1941 diciembre 31/1942 marzo 24)
10. Solicitud de agua presentada por Antonio Lasheras por medio de una derivación de una toma de agua de la tubería del jardín de la estación. (1942 febrero 13/1942 febrero 24)
11. Pedidos de materiales que se tienen solicitados para la vía de enlace del depósito Cerro Negro a Santa Catalina. (1942 marzo 9/1942 abril 8)

1.Construcción de caseta de transformación para suministrar energía eléctrica a las instalaciones del proyecto de Recorrido y Talleres de Material Móvil en la estación. - Incluye: Planos. (1927 julio 20/1928 febrero 24)

2. Proyectos de taller de tapicería y pintura de coches y de vivienda para el personal directivo de la estación. - Contiene: Documentación tramitando los proyectos de 1927 y su modificación de 1929; Memorias, planos, pliegos de condiciones, mediciones, cuadros de precios y presupuestos. (1927 diciembre 30/1929 enero 19)
3. Concurso-subasta para la construcción de la caseta de transformación del proyecto de Recorrido y Talleres de Material Móvil en la estación. (1928 julio 13/1928 noviembre 20)
4. Construcción de tramo de vía de translación para el carro transbordador eléctrico instalado en el nuevo Recorrido de la estación. (1929 noviembre 23/1930 febrero 26)

1. Oficios, minutas, notas, informes, etc. relativos a la construcción de las instalaciones necesarias para los almacenes generales de Villaverde Bajo y a otras instalaciones en la estación de Aranjuez. - Incluye: Presupuestos ; Plano del terreno correspondiente a la División de Almacenes Generales en Villaverde Bajo (Escala 1:1000) (68 x 96 cm) ; Condiciones particulares ; Resumen del gasto ; Justificación del exceso de gastos previsto para la construcción de los nuevos almacenes generales ; Nota relativa al gasto a realizar a partir del 1º de enero de 1924 para la terminación completa de las obras de la estación de Aranjuez ; Pliego de condiciones para la construcción de un edificio destinado a almacén de varios y cobertizo anexo al mismo en Villaverde Bajo ; etc. (1923 noviembre 18/1927 septiembre -)
2. Proyecto de terminación de los nuevos almacenes generales de Villaverde Bajo (3 ejemplares, sólo 1 completo y más duplicados). - Contiene: Memoria, Planos: Plano general (Escala 1:1000) (46 x 62 cm), Planta general de las estanterías (56 x 58 cm), Estanterías A (31 x 175 cm), Estanterías B (31 x 189 cm) y Estanterías C (31 x 281 cm) ; Pliego de condiciones ; Mediciones, cuadro de precios y Presupuestos; y Duplicados. (1927 abril 28)
3. Oficios, minutas, correspondencia, etc. relativas al proyecto del año 1927 de terminación de los almacenes generales de Villaverde Bajo y a otras instalaciones relacionadas. (1927 abril 28/1930 abril 23)
4. Oficios, minutas y demás documentación relativa a la construcción de estanterías metálicas construidas por los Srs. Navarro y Herrera para el almacén de varios, que forma parte del proyecto de terminación de los nuevos almacenes generales en Villaverde Bajo. - Incluye: Plano con la disposición de las estanterías en el piso 2º y sotano del almacén de varios (Escala 1:200) (51 x 96 cm); Acta de recepción provisional de la estanterías del almacén de varios de los almacenes generales ; Contrato privado para la ejecución con cargo a la Caja Ferroviaria del Estado de las estanterías metálicas para el almacén de varios entre la Compañía MZA y los contratistas Navarro y Herrera ; Condiciones para la contratación por subasta limitada, con cargo a la Caja Ferroviaria del Estado, de la construcción de estanterías para el almacén de varios que se integra dentro de las nuevas instalaciones que comprende el proyecto de terminación de los nuevos almacenes generales en Villaverde Bajo; etc. (1926 abril 17/1930 diciembre 5)

1. Autorización para atravesar la línea con una tubería de desagüe y verter las aguas sobrantes al río Jalón, solicitada por la S.A. "La Azucarera Labradora", de Calatayud. (1900 julio 24/1908 marzo18)
2. Autorización para construir una pared de cerca en un terreno lindante con los de la Compañía, solicitada por la S.A. "La Azucarera Labradora". ( 1902 marzo 18/1902 julio 15)
3. Compra de una parcela de la Compañía situada junto al km 214,219,solicitada por los Sres. Gregorio del Río, Vicente Melendo y Antonio Flons. (1902 octubre 30/1911 marzo 7)
4. Construcción de nuevos retretes en la estación. (1904 septiembre 24/1905 enero 7)
5. Proyecto de pabellón para servicio de Correos en la estación. (1904 noviembre 17/1905 octubre 16)
6. Proyecto de modificación y ampliación de vías en la estación. (1905 enero 3/1905 septiembre 5)
7. Compra de un terreno de la Compañía, solicitada por Robustiano Fernández. (1905 marzo 8/1905 marzo 24)
8. Habilitación de un local para descanso de las parejas de escolta de la Guardia Civil, solicitada por la misma. (1905 septiembre 25/1905 diciembre 13)
9. Autorización para construir en terrenos inmediatos a la estación, solicitada por Pedro Rubio. (1906 enero 31/1906 abril 4)
10. Proyecto de reforma de la cochera de carruajes con un carro transbordador sin foso. (1906 junio 23/1907 diciembre 19)
11. Proyecto de construcción de dependencias para mozos, Almacén del Recorrido y caloríferos en el interior de la cochera para carruajes. (1906 agosto 18/1907 diciembre 5)
12. Traslado de una mesa de 20 cubiertos construida para la fonda de la estación, a Madrid. (1907 abril 15/1907 mayo 8)
13. Proyecto de instalación de una vía para el taller de enyección en la estación. (1909 febrero 9/1909 junio 23)
14. Obras de reparación y mejora en las viviendas de la estación. (1909 marzo 2/1909 mayo 8)
15. Reforma, desinfección y limpieza de los retretes de la estación*. ( 1909 marzo 18/1909 marzo 26)
16. Construcción de pozos mourás y filtros para los retretes del público, edificio de viajeros y fregadera de la fonda de la estación, solicitada por el Ayuntamiento. (1910 julio 28/1911 enero 9)
17. Modificación de la planta alta del edificio de viajeros para ampliarla vivienda del Jefe de Estación. (1910 octubre 8/1910 noviembre 10)
18. Autorización para sustituir el alumbrado eléctrico por el de acetileno en la fonda, solicitada por Robustiano Fernández. (1911 marzo 22/1911 marzo 30)
19. Autorización para instalar luz eléctrica por su cuenta en la casa que ocupa en la estación, solicitada por el asentador Mariano Entrena Guillén. (1911 agosto 5/1911 agosto 9)
20. Instalación de alumbrado eléctrico en la estación por la Sociedad Anónima "La Marcial". (1911 agosto 9/1911 septiembre 12)
21. Arriendo a la Compañía de una casa que existe en la carretera de Valencia por parte de Robustiano Fernández. (1912 agosto 30/1914 marzo 3)
22. Reclamación por los desperfectos causados en una casa destinada a dormitorio de personal, presentada por Ignacio López. (1913 abril 10/1913 abril 24)
23. Ofrecimiento de una casa en venta, a la Compañía, realizado por Robustiano Fernández. (1913 junio 19/1913 junio 28)
24. Plano de la ampliación de la fonda y establecimiento de un almacén. (1913 octubre 24)
25. Cubrimiento de una acequia situada en el km 244,400 de la línea. (1913 diciembre 4/1914 marzo 21)
26. Venta de un terreno en la estación para construir un edificio solicitada por Casimiro Mateo González. (1915 abril 9/1915 septiembre 10)
27. Artículo adicional al contrato celebrado entre la Compañía y Vicente Moros Barca, para la concesión de la Cantina en la estación. (1915 mayo 3/1915 mayo 17)
28. Instalación de bocas de riego y canalización para el riego del patio de viajeros, solicitada por el Ayuntamiento. (1915 julio 24/1915 agosto 23)
29. Obras de reparación en la estación. (1915 noviembre 10/1916 abril 2)
30. Instalación de dos vías donde estacionar máquinas en la estación. (1915 diciembre 2/1915 diciembre 14)
31. Proyecto de ampliación de vías en la estación. (1916 febrero 9/1916 julio 26)
32. Compra de un terreno a Francisco Pérez Vicioso para ensanche de la playa. (1916 marzo 27/1916 agosto 8)
33. Autorización para realizar obras junto al km 244,780, solicitada por Vicente Martínez Ezquerra. (1916 abril 26/1916 agosto 8)
34. Autorización para instalar una mesa petitoria en el andén de la estación, solicitada por Juan BIas y Fausto Navarro. (1916 agosto 11/1916 agosto 12)
35. Contrato entre la Compañía e Ignacio López para el alquiler de una casa. (1916 octubre 15)