Las obras de la actual estación de Zamora comenzaron en 1927, dirigidas por el Ingeniero Marcelino Enríquez, pararon en 1932, en 1935 se reiniciaron volviendo a ser detenidas durante la Guerra Civil, inaugurándose por fin en 1958, un año después de ponerse en servicio la línea Medina del Campo-Zamora-Orense-Vigo.
El primer tren llegó a la ciudad procedente de Medina del Campo, el 28 de mayo de 1864, y como hito en el camino de hierro de la Ruta de la Plata (Astorga-Plasencia) recibió nuevas circulaciones en el año 1896. Estos inicios tenían su base operativa en la primitiva y sobria estación que se encontraba cerca de la actual.