1. Solicitud de varios propietarios y comerciantes de la provincia de Huelva para que se modifique el emplazamiento proyectado para la estación. (1878 enero 29/1880 diciembre 6)
2. Revestimiento del foso del puente - báscula de la estación. (1883 febrero 28/1883 marzo 17)
3. Cierre del muelle de mercancías de la estación. - Incluye: Plano de situación del proyecto de cierre del muelle de mercancías (Escala 1:100) (31 x 68 cm); y Plano del proyecto de lucerna para el muelle (Escala 1:10) (41 x 77 cm); Plano de situación y elevación de un tramo del proyecto de cierre del muelle cubierto (Escala 1:100 y 1:20) (31 x 103 cm); y Presupuesto. (1890 agosto 22/1891 julio 28)
4. Autorización a Dolores López Doytalaguerra, aguadora de la cantina de la estación, para construir otro departamento de madera que enlace con la cantina para su ampliación. (1894 febrero 16/1894 mayo 28)
5. Instalación de garitón de madera con cristales para factoría de equipajes y Gran Velocidad en las estaciones de San Juan del Puerto, La Palma del Condado, Sanlúcar la Mayor y Triana. - Incluye: Plano de planta, alzado y detalles del garitón para factoría de equipajes (Escala1:20 y 1:5) (31 x 96 cm). (1894 marzo 19/1895 mayo 14)
6. Solicitud del alcalde de San Juan del Puerto para que se arregle el camino de acceso a la estación. (1897 octubre 28/1898 octubre 14)
7. Aumento de vías y placas giratorias o plataformas en la estación. - Incluye: Esquema general de situación de la estación con indicación de la placa giratoria proyectada (A4); Presupuestos; Plano de situación del proyecto de aumento de vías y plataformas (Escala 1:500) (24 x 53 cm); Esquema general de situación de la estación con indicación del aumento de vías y plataformas proyectadas (A4). (1897 noviembre 19/1899 mayo 31)
8. Autorización a Romana Rodríguez del Toro para la instalación de una cantina en la estación, frente al km 96,080 de la línea - Incluye: Croquis que acompaña a la solicitud presentada con indicación de la situación de la cantina que se proyecta (A3); y Croquis de situación de la cantina proyectada (A3). (1897 noviembre 23/1897 diciembre 31)
9. Solicitud de los señores Barrés y Vides para establecer una vía estrecha desde su bodega al muelle descubierto de la estación. (1897 diciembre 16/1898 enero 15)
10. Modificación y ensanche de entrevías en la estación. (1898 enero 8/1898 marzo 1)
11. Solicitud de Francisco Ribeill Gardón para construir un muro de división en terrenos de su propiedad lindantes con la estación, donde ha construido una bodega llamada "La Juanita". - Incluye: Croquis. (1898 julio 6/1898 agosto10)
12. Apertura de pozos en terrenos propiedad de Francisco Jiménez próximos a la estación. - Incluye: Plano de situación de dos pozos abiertos fuera de la línea (Escala 1:500) (A3). (1898 julio 7/1898 julio 9)
13. Obras en la estación por la Compañía de Ríotinto. (1899 abril 22/1899 mayo 20)
14. Autorización a Carlos Schmidt y Cía para construir un muro de contención en terrenos de su propiedad destinado al sostenimiento de las tierras del desmonte que limita con la bodega para exportación de vinos que poseen, y para establecer una rampa para la carga y descarga de los bocoyes de su bodega. - Incluye: Plano del proyecto de muro solicitado (Escala 1:500) (A4); y Plano del proyecto de rampa para la bodega de Carlos Schmidt (Escala 1:500) (33 x 52 cm). (1899 julio 26/1900 febrero 23)
15. Autorización a la Compañía de Ríotinto para instalar una tubería de conducción de aguas en la estación. - Incluye: Plano del proyecto de servicio de aguas paral estación de San Juan de la Compañía Ríotinto (Escala 1:500) (56 x 96 cm). (1900 julio 2/1907 octubre 2)
16. Solicitud del Alcalde de San Juan del Puerto para que se mejore el aspecto del corral y chozo de traviesas adosado a la casilla del guarda del km 98,095, situada en las proximidades de la estación. (1901 junio 27/1901 agosto 26)
17. Enlosado o asfaltado del muelle cubierto de la estación. (1904 mayo 19/1904 diciembre 10)
18. Desperfectos en los discos avanzados y modificación de la disposición de señales en la estación. - Incluye: Croquis con indicación de la situación de los discos (A4); Plano general de situación de la estación con la nueva disposición de señales (Escala 1:500) (31 x 246 cm). (1907 noviembre 6/1908 julio 4)
19. Solicitud del Servicio de Material y Tracción para que se le ceda la casilla destinada para almacén para vivienda del fogonero de la toma de agua de la estación, o bien se le permita construir una habitación adosada a dicha casilla. (1909 febrero 24/1909 marzo 6)
20. Solicitud del Servicio de Movimiento para que se tabique la puerta que comunica la vivienda del Jefe de estación con la del factor en la planta principal del edificio de viajeros de la estación, y desperfectos causados por el Jefe de estación en la cocina de su vivienda. - Incluye: Croquis del tabique proyectado (A4). (1911 marzo 15/1912 junio 20)
21. Solicitud del Alcalde de San Juan del Puerto para que se sustituya la valla de madera que separa los terrenos de la Compañía y los de la población en la estación, por una valla de mampostería para mejor ornato de salida y entrada de la estación. (1912 febrero 22/1912 marzo 22)
22. Modificación de la vía de carga en el muelle. (1913 mayo 24/1913 octubre 23)
23. Solicitud de Joaquín Garrido Santa María para cercar una finca de su propiedad próxima a la estación. - Incluye: Plano de situación (Escala 1:500) (31 x 102 cm). (1917 octubre 25/1917 diciembre 12)

1.Revisión de puentes metálicos de la Red. – Incluye: Nota de los trabajos hechos por el taller con la revisión de tramos en las líneas de Zaragoza, Madrid-Alicante, Albacete-Cartagena, Manzanares-Córdoba, Mérida-Sevilla y ramal Almorchón-Belmez.; Relación de gastos realizados en la conservación de los tramos metálicos desde 1912 a 1927 en las líneas Madrid-Zaragoza, Madrid-Alicante, Albacete-Cartagena, Aranjuez-Cuenca, Alcázar-Ciudad Real, Manzanares-Córdoba, Córdoba-Sevilla, Mérida-Sevilla, Sevilla-Huelva, Madrid-Ciudad Real, Ciudad Real-Badajoz, Castillejo-Toledo, Almorchón-Belmes, Aljucén-Cáceres y Valladolid-Ariza. (1927 febrero 28 / 1927 agosto 19)