1. Reales Órdenes y sus prórrogas, referentes a la concesión de la línea. (1870 julio 2 / 1881 julio 3)
2. Reales Órdenes sobre aprobación de obras y apertura de secciones de la línea. (1874 julio 17 / 1881 septiembre 20)
3. Informes de datos de la construcción de la línea. - Contiene: Oficios y minutas; y Cuadros de presupuestos y cuadros de variaciones sobre el trazado. (1880 julio 7 / 1882 enero 24)
4. Correspondencia acerca del puente sobre el río Guadiana. (1881 julio 18 / 1881 diciembre 15)
5. Soluciones arbitrales sobre las estaciones de Mérida, Villanueva y Tocina. - Contiene: Oficios y minutas; Presupuesto de las obras; Relación de dependencias y sus materiales de herramientas y útiles; y Plano general de la estación de Mérida. (Escala 1:500) (56 x 210 cm) (1881 julio 30 / 1883 julio 23)
6. Reconocimiento de la línea entre Tocina y El Pedroso. - Contiene: Oficios y minutas; e Informe sobre el reconocimiento de la línea y pase de libre circulación de la Compañía de los Ferrocarriles Extremeños, a nombre de Francisco Baena y un capataz. (1881 julio 30 / 1881 octubre 30)
7. Presupuesto tipo para la terminación de la línea. - Contiene: Oficios y minutas y Presupuesto tipo. (1881 agosto 3 / 1882 marzo 2)
8. Documentación correspondiente a la entrega y recepción de la sección de Tocina a El Pedroso, de la línea de Mérida a Sevilla. - Contiene: Oficios y minutas; Actas de entrega y recepción respectivamente; e Inventario de material de la línea. (1881 septiembre 9 / 1881 diciembre 21)
9. Nombramientos de personal. (1881 septiembre 24)
10. Pedidos de material para el contratista. - Contiene: Oficios y minutas; y Pedido de útiles y herramientas y de traviesas. (1881 septiembre 29 / 1881 noviembre 26)
11. Oficios y minutas sobre la remisión de planos a Material y Tracción. (1881 octubre 3 / 1881 diciembre 26)
12. Oficios y minutas sobre las quejas por la falta de actividad y los retrasos en la construcción de la línea. (1881 octubre 3 / 1881 octubre 28)
13. Oficios y minutas relativos a la explotación de la sección de Tocina a El Pedroso. (1881 octubre 4 / 1882 enero 11)
14. Datos sobre el replanteo de la sección de Llerena a El Pedroso. - Contiene: Oficios y minutas; Perfil longitudinal de la comprobación del replanteo (34 x 50 cm) y de la comprobación del nuevo replanteo de la sección (35 x 82 cm). (1881 octubre 7 / 1881 diciembre 16)
15. Relaciones valoradas de las obras ejecutadas en la línea. - Contiene: Oficios y minutas y relación valorada. (1881 octubre 28 / 1881 diciembre 22)
16. Oficios y minutas relativos a la construcción de una alcantarilla en el km 10,470 de la línea. (1881 noviembre 17 / 1881 diciembre 29)
17. Contrato entre las Compañías de los Ferrocarriles de Madrid a Zaragoza y Alicante y Ferrocarriles Extremeños, para el uso conjunto de la estación de Mérida. (1881 noviembre 28).
18. Oficios y minutas sobre la reparación de la cochera de carruajes de la estación de Llerena. (1881 noviembre 17 / 1881 diciembre 29)
19. Oficios y minutas sobre el servicio sanitario en la sección de Tocina a El Pedroso. (1881 diciembre 6)
20. Oficios y minutas sobre el reconocimiento de las grúas hidraúlicas en la estación de Tocina. (1881 diciembre 7 / 1881 diciembre 28)
21. Oficios y minutas sobre la reparación de cambios de vía en la sección de Tocina a El Pedroso. (1881 diciembre 14)
22. Oficios y minutas del informe sobre las cargas de las locomotoras Cockerill. (1881 diciembre 15 / 1881 diciembre 29)
23. Oficios y minutas de la relación de obras a realizar en las estaciones de la línea. (1881 diciembre 24 / 1881 diciembre 28)
24. Oficios y minutas sobre las precauciones para el paro de los trenes por el km 11 de la línea. (1881 diciembre 27)
25. Relaciones de las obras ejecutadas y pendientes de ejecución en la línea. Sección de Mérida a Llerena - Contiene: Oficios y minutas; Relación de obras en diferentes actuaciones y Gráfico de explanación y balasto (Escala 1:20000) (40 x 80 cm). (1882 enero 3 / 1883 julio 19)
26. Relaciones de las obras ejecutadas y pendientes de ejecución en la línea. Sección de Mérida a Llerena - Incluye: Oficios y minutas; Relación de obras en diferentes actuaciones y gráfico de explanación y balasto (Escala 1:20000) (40 x 80 cm). (1882 enero 3 / 1883 julio 19)
27. Relación de las obras de fábrica comprendidas en los tres primeros trozos de la línea. Sección de Mérida a El Pedroso. - Contiene: Oficios y minutas y Relación de obras en diferentes actuaciones. (s.f.)
28. Solicitud de información acerca de la superficie de terreno tomado a la hacienda "Los Poyales" - Contiene: Oficios y minutas y plano general de la hacienda en relación a la línea (Escala 1:400) (31 x 210 cm). (s.f.)

Actuaciones en la estación de Villanueva y Alcolea

1. Autorización para establecer un cruce eléctrico por el km 199,132, solicitada por Emeterio Sáenz de Tejada. (1914 abril 28/1921 junio 4)
2. Proyecto de muelle cubierto, cerrado y descubierto. (1917 enero 10/1918 enero 18)
3. Autorización para establecer un cruce telefónico por el km 199,048, solicitada por Isaías Vázquez Román. (1920 enero 22/1935 octubre 7)
4. Reparaciones y modificaciones en la estación. (1928 noviembre 21/1929 noviembre 24)
5. Proyecto de instalación de 4ª vía. (1938 febrero 15/1938 noviembre 19)

1. Reparaciones en el vestíbulo y en la vivienda del Factor. (1930 enero 3/1941 abril 4)
2. Autorización para establecer un cruce aéreo por el km 188,215, para el transporte de piedra caliza desde la cantera de Risco Real a la estación de Arenillas*. - Incluye: Plano parcial con la situación del cable aéreo que desea instalar Francisco Rivas (Escala 1:500) (A3); Croquis de la sección longitudinal y transversal del puente protector del cable aéreo, montado sobre castilletes de madera (duplicado) (A4); Contrato entre la Compañía MZA y Francisco Rivas Castellví; Propuesta que justifica la estabilidad del puente protector del cable aéreo instalado en la estación de Arenillas, sin necesidad de efectuar la prueba prescrita por la Comisaría; Nota para el Ingeniero Jefe de la Comisaría del Estado, Ricardo Aguilera; Plano de situación del cruce de la vía por el km 188,215,20 con un cable aéreo de Francisco Rivas Castellví (triplicado) (Escala 1:500) (A4); Factura. (1934 junio 5/1940 mayo 13)
3. Autorización para instalar dos hornos de cal y una casa de máquinas en la estación, solicitada por Enrique Rodríguez. - Incluye: Croquis de la estación de Arenillas (A4); Plano parcial con el emplazamiento de los hornos que proyecta Enrique Roediger y ampliación de vías (triplicado) (Escala 1:500) (31 x 145 cm); Plano la superficie a ocupar por la casa de máquinas y hornos que pretende construir Enrique Roediger (Escala 1:500) (A4); Contratos entre la Compañía MZA y Enrique Roediger. (1937 julio 27/1941 junio 28)
4. Proyecto para instalación de 3ª vía de circulación y prolongación de la del muelle. - Incluye: Presupuesto; y Plano de situación y perfiles transversales del proyecto para instalación de 3ª vía de circulación (Escala 1:500) (31 x 273 cm). (1938 abril 9/1938 abril 13)

1. Informe sobre la amenaza existente sobre el puente del km 199,742 en su estribo izquierdo y terraplén de acceso, debido a erosiones que producen las aguas del río Guadalquivir. (1937 diciembre 20/1942 enero 14)
2. Proyecto de construcción de 4ª vía en la estación. (1938 febrero 19/1939 marzo 6)
3. Proyecto de construcción de un dique de defensa del estribo, lado de Mérida, del puente sobre el Guadalquivir, km 199,700. (1939 octubre 16/1941 marzo 11)
4. Repartimiento General de Utilidades. (1940 febrero 14/1940 febrero 21)
5. Autorización para establecer un cruce de energía eléctrica por el km 199,142, solicitada por Isaías Vázquez Román. (1940 septiembre 18/1941 noviembre 29)
6. Obras de reparación. (1941 julio 28/1941 agosto 21)

1. Plano del prolongación de la vía apartadero. (1903 enero 15)
2. Plano de vía y muelle descubierto. (1906 junio 27)
3. Plano de situación de viviendas para empleados. (1911 marzo 1)
4. Alzado de ampliación del edificio de viajeros. (1912 mayo 23)

1. Ampliación de vías (Escala 1:500) (31 x 138 cm). (1902 abril 12)
2. Plano general del proyecto de ampliación de vías y andenes, muelle cubierto y cerrado, muelle descubierto (duplicado) (Escala 1:1000) (32 x 105 cm), y establecimiento de la 5ª vía (Escala 1:1000) (32 x 101 cm). (1910 febrero 10 /1911 noviembre 15)
3. Plano de caño solicitado por Juan Márquez Fernández, alcalde de Tocina (Escala 1:500) (32 x 64 cm). (1929 febrero 28)
4. Situación de báscula solicitada por la Azucarera Ibérica (Escala 1:500) (A3). (1931 abril 2)
5. Situación de la báscula solicitada por la Azucarera de Sevilla (Escala 1:500) (A3). (1940 febrero 17)