En 1899, la Compañía del Sur de España escoge a Linares como punto de arranque de un ferrocarril que permitiera continuidad de viaje a las personas que procedentes de allende Despeñaperros quisieran acercarse hacia tierras granadinas y almerienses. Para la compañía ferroviaria, el objetivo prioritario era la conexión con la vía de la compañía MZA, la cual tenía lugar en el nudo de Linares-Baeza desde 1899, realizando transbordo los viajeros que, procedentes de Almería (y, más tarde, de Granada), se dirigían a Madrid. Sin embargo, en la concesión administrativa figuraba la obligación de culminar la línea en el casco urbano de Linares. Para ello, la Compañía del Sur hubo de construir la línea hasta Linares, con una fuerte pendiente para la explotación ferroviaria, y de muy dudosa rentabilidad comercial, quedando culminado en 1904. Dado que la Compañía del Sur tenía asignadas las vías del lado este de la estación de Linares-Baeza, para dirigirse hacia Linares-San José había de cruzar las vías de MZA, construyéndose un puente metálico que llegó a ser utilizado para la descarga de minerales, y del que en la actualidad no queda rastro, pudiendo verse solamente sus estribos. Es así que en el año 1904 se da finalización a la línea hacia la estación de Linares-Sur, también conocida como Linares- Almería o Linares -San José.