1. Proyecto de marquesina para los andenes de viajeros en las estaciones de Alcalá y Guadalajara. - Incluye: Memoria ; Planos y elevación de marquesinas ; Presupuesto. (1859 mayo 31/1860 agosto 31)
2. Pintura de faldones y frontones de muelles cubiertos en las estaciones de Alcalá y Guadalajara.- Incluye: Presupuesto. (1860 abril 12/1860 mayo 5)
3. Autorización para construir un muro de cerramiento en una finca, solicitada por Manuel y Rafael Bertrand. (1860 julio 14/1860 julio 30)
4. Quejas del Guarda Lucas Ruiz contra el Alcalde de Alcalá, por el poco respeto que se tiene a la policía de ferrocarriles, e incumplimiento de la Ley de Policía de Ferrocarriles. (1861 junio 24/1861 mayo 21)
5. Reclamación presentada por Pablo Soria y Ramón Múgica para que se le permita el paso de los carruajes al muelle de la estación. (1862 febrero 6/1862 febrero 27)
6. Construcción de caminos que comunican la ciudad con la estación. (1862 marzo 29/1862 abril 2)
7. Informe y presupuesto para el afirmado del muelle de la estación. (1862 diciembre 16/1862 diciembre 17)
8. Solicitud de indemnización por daños causados por el incendio ocurrido en la ciudad el 18 de julio de 1862, presentada por varios vecinos de Alcalá de Henares. (1863 julio 23/1863 agosto 22)
9. Autorización para construir una casa en terrenos lindantes a la estación, solicitada por Pedro Caramés. (1863 septiembre 18/1863 octubre 22)
10. Autorización para edificar en terrenos lindantes con el cerramiento de la estación, solicitada por Francisco Huertas. (1865 febrero 25)
11. Permuta de un terreno propiedad de la familia Bertrán de Lis, km 31, por otro propiedad de la Compañía, km 34. (1865 junio 7/1865 julio - )
12. Reparación del puente del Torote, km 29 de la línea. - Incluye: Plano del retranqueo del tramo y reparación de las pilas ; Contrato ; Presupuesto. (1868 junio 15/1878 enero 3)
13. Autorización para reconstruir una tapia en terrenos lindantes con el ferrocarril, solicitada por Marcelino Clós. - Incluye: Plano de situación. (1873 junio 7/1873 octubre 27)
14. Autorización para construir en terrenos fuera del perímetro de la estación, solicitada por Tomás Pérez. (1878 febrero 13)
15. Reparación del piso del muelle de mercancías. (1881 julio 12/1881 agosto 4)
16. Queja del Ayuntamiento a la Cía. por haber abierto dos zanjas cortando el paseo del Chorrillo, km 33 (1884 mayo 19/1884 mayo 30)
17. Proyecto de reforma de las marquesinas de las estaciones de Alcalá y Guadalajara. - Incluye: Plano. (1886 enero 27)
18. Proyecto de ampliación de vías y muelles en la estación. - Incluye: Plano. (1886 julio 13/1886 noviembre 24)
19. Reparación de los daños causados en las cubiertas del muelle de la estación. (1886 diciembre 16/1887 marzo 9)
20. Autorización para efectuar obras en terrenos lindantes al cerramiento de la estación, solicitada por Tomás Pérez Fernández. (1889 agosto 3/1889 agosto 17)
21. Solicitud para que se construya un cierre de tapia de la estación. (1889 mayo 1)
22. Solicitud para que se repare la sala de viajeros de la estación. ( 1889 julio 10/1889 julio 16)
23. Autorización para continuar la colocación de aceras en el trayecto que media entre la estación y el paso denominado "De la Estación", solicitada por el Ayuntamiento. (1890 marzo 3/1890 marzo 8)
24. Solicitud presentada por el Ayuntamiento a la Compañía para que ésta contribuya al arreglo del camino denominado de "Talamanca". (1891 enero 8/1892 enero 12)
25. Solicitud para que se ordene el cierre de la estación y se ordene a una persona el cuidado de las puertas de acceso a la misma. (1891 febrero 28/1891 mayo 3)
26. Autorización para ejecutar obras en el km 34, solicitada por la Comandancia de Ingenieros. (1891 mayo 12/1891 junio 24)
27. Solicitud de reemplazo de la plataforma de la vía muerta por otra de dos vías. (1891 junio 17/1891 septiembre 3 )
28. Instalación de una plataforma nueva de 4 m. en la vía del muelle de la estación. - Incluye: Presupuesto y relación de gastos. (1891 noviembre 25/1892 marzo 23)
29. Solicitud para que se repare el pavimento de la parte cubierta del muelle de mercancías con enlosado de piedra. (1893 mayo 8/1894 mayo 18)
30. Autorización para cerrar una tierra lindante con el paseo de la estación, solicitada por Soledad Arnesto y Campuzano. - Incluye: Croquis de situación(1893 diciembre 7/1893 diciembre 15)
31. Autorización para abrir una zanja para colocar una tubería en el km 34, solicitada por el Ayuntamiento. (1893 diciembre 22/1894 enero 3)
32. Solicitud para que se establezcan dos garitas de madera para guardagujas. (1895 junio 21/1895 diciembre 30)
33. Solicitud para que se traslade la casilla nº 18 del paso a nivel, km 33, para poder restaurar el muro de cerramiento del cementerio católico, presentada por el Ayuntamiento. - Incluye: Plano de situación (1896 febrero 1/1896 abril 6)
34. Construcción de un quiosco para la aguadora, solicitado por Adela Benet y Sanz. - Incluye: Plano del quiosco. (1898 febrero 10/1900 diciembre 20)
35. Autorización para cerrar una finca con una tapia, solicitada por Soledad Armesto. - Incluye: Planos de situación. (1899 septiembre 30/1903 julio 6)
36. Solicitud para cerrar con puertas las entradas de los pasillos que dan al vestíbulo del edificio de viajeros. (1899 noviembre 14/1900 enero 3)
37. Proyecto de cierre del muelle cubierto de la estación. - Incluye: Planos del proyecto ; Contratos ; Cuadro comparativo de las proposiciones presentadas ; Presupuesto ; (1900 marzo 28/1901 enero 3)
38. Proyecto de nueva distribución en la planta del edificio de viajeros. - Incluye: Planos del proyecto ; Plano de la estación ; Presupuesto ; Recortes de PRENSA (1900): La estación de Alcalá de Henares / R. Brigo En: El liberal, 12 de septiembre ; Heraldo de Aragón (Zaragoza), 10 de septiembre ; De Calatayud En: La Derecha (Zaragoza), 10 de septiembre ; Desde Alcalá / H. de A. En: Heraldo de Madrid, 12 de septiembre ; La estación de Alcalá / El Corresponsal En: La Correspondencia de España, 13 de septiembre ; Accidentes ferroviarios En: El liberal, 13 de septiembre ; Con retraso ; Compañía de ferrocarriles En: La Alianza Aragonesa, 11 de septiembre. (1900 marzo 28/1900 noviembre 22)
39. Autorización para levantar un piso en su casa lindante a la vía, solicitada por Tomás Ruiz. - Incluye: Plano de situación ; Plano de la fachada proyectada al patio de viajeros ; Plano de las fachadas a la plaza del Ferrocarril y a la calle de la Estación. (1900 febrero 13/1901 enero 3)
40. Solicitud de cesión de unas fajas de terreno propiedad de la Compañía para establecer dos caminos laterales entre el camino de Ajalvir y el paseo del Chorrillo, presentada por el Ayuntamiento. - Incluye: Plano y perfiles entre los km 32,139 y 32,591 ; Plano entre el camino de Ajalvir, km 32,139 y la estación(1900 diciembre 4/1901 marzo 4)
41. Proyecto de prolongación de andenes. - Incluye: Plano.(1901 febrero 19/1901 febrero 27)
42. Autorización para realizar obras en su casa, solicitada por la Confitería de Marón. - Incluye: Plano de situación. (1902 octubre 1/1903 marzo 3)
43. Relación de obras ejecutadas en los años 1900 a 1902. (1903 agosto 1)
44. Proyecto de ampliación y rectificación de vías y andenes. - Incluye: Plano de situación, plantas y alzado de la estación para del proyecto a fecha de 1903 (Escala 1:500); Plano de situación, plantas y alzado de la estación para del proyecto a fecha de 1904 (Escala 1:500) (ferroprusiato) (31 x 270 cm)*; Presupuesto. (1903 noviembre 5/1907 agosto 17)
45. Autorización para plantar olivos entre las estaciones de Alcalá y Meco solicitada por el Sr. Baüer y el Marqués de Luque. (1904 marzo 8/1904 marzo 31)
46. Autorización para cerrar con verja una huerta, solicitada por las Religiosas Adoratrices. - Incluye: Croquis de la tapia y situación ; Plano de situación. (1905 diciembre 21/1906 enero 31)
47. Proyecto de una vía de playa. - Incluye: Planos ; Presupuesto. (1906 enero 19/1907 junio 24)
48. Autorización para construir una tapia de cierre frente al km 33,500, solicitada por Ignacia Femández Martínez. - Incluye: Plano de situación. (1906 enero 22/1906 febrero 10)
49. Autorización para transitar con caballería por la cuneta de la vía entre el paso a nivel del km 32,866 y una finca privada, solicitada por Mariano Gallo Alcántara. (1906 abril 16/1906 junio 27)
50. Autorización para engalanar la entrada de la estación para las fiestas, solicitada por el Ayuntamiento. (1906 agosto 14/1906 agosto 21)
51. Solicitud de que se abra una salida de aguas en la tapia de la estación para evitar perjuicios a una finca, presentada por Tomás Ruiz. - Incluye: Plano de situación. (1906 noviembre 12/1907 mayo 22)
52. Autorización para instalar una garita de madera en el patio de viajeros, solicitada por el Ayuntamiento. - Incluye: Plano de situación. (1907 febrero 2/1907 marzo 5)
53. Autorización para depositar gratuitamente materiales para la construcción del salto de agua de Bolarque en las estaciones de Alcalá, Guadalajara y Vellisca, solicitada por Estanislao Urquijo. - Incluye: Plano de situación en la estación de Vellisca ; Plano de la estación de Vellisca con emplazamiento. (1907 abril 16/1907 octubre 2)

1. Vallecas. (1889 marzo 22)
2. Vicálvaro. (1886 -)
3. Apartadero de La Agustina. (1889 abril 5)
4. San Fernando de Henares. (1886 abril 19)
5. Torrejón de Ardoz (31 x 126 cm). (1869 julio 3)*
6. Alcalá de Henares (coloreado) (31 x 140 cm). (1869 julio 3)*
7. Meco (31 x 163 cm). (1884 julio 15/1886 abril --)*
8. Azuqueca de Henares (31 x 126 cm). (1869 julio 3)*
9. Guadalajara (coloreado) (Escala 1:500) (60 x 167 cm). (1869 julio 3)*
10. Croquis de apartadero de Valdelobos, Espartinas, Villamejor, Agustina y Chocolatero de las líneas de Madrid a Toledo, a Alicante y a Zaragoza. (1886 mayo 14)
11. Fontanar. (1882 diciembre -)
12. Yunquera. (1869 julio 3)
13. Humanes. (1886 mayo 1)
14. Espinosa. (1886 abril 21)
15. Jadraque. (1869 julio 3)
16. Matillas. (1869 julio 3)
17. Baides. (1886 mayo 1)
18. Sigüenza (Escala 1:500) (61 x 133 cm). (1869 julio 3)*
19. Alcuneza. (1869 julio 3)
20. Salinas de Medinaceli. (1869 julio 3)
21. Carpetilla del plano de Arcos de Jalón. (vacío) (1881 mayo -)
22. Santa María de Huerta. (1882 diciembre -)
23. Ariza. (1889 marzo 14)
24. Cetina. (1889 marzo 14)
25. Alhama de Aragón. (1869 julio 3)
26. Bubierca (31 x 84 cm). (1887 julio -)*
27. Ateca. (1869 julio 3)
28. Terrer. (1882 diciembre -)
29. Calatayud (Escala 1:500) (31 x 162 cm). (1882 diciembre -)*
30. Paracuellos. (1882 diciembre -)
31. Morés. (1887 mayo 24)
32. Morata. (1890 agosto 15)
33. Ricla. (1885 diciembre 11)
34. Calatorao (vacío). (s.f.)
35. Salillas de Jalón (vacío). (s.f.)
36. Épila. (1890 agosto 15)
37. Rueda de Jalón (vacío). (s.f.)
38. Plasencia de Jalón (vacío). (s.f.)
39. Grisén (vacío). (s.f.)
40. Casetas. (1881 julio ??)
41. Utebo - Monzalbarba (vacío). (s.f.)
42. Plano general (42 x 143 cm) y planta del edificio de Campo Sepulcro de la estación de Zaragoza (A4). (1887 febrero 10)
43. Índice de los planos generales de esta línea. (s.f.)

1. Planta (A3) y alzado del proyecto y proyecto definitivo de la estación de Alcalá de Henares (A3) aprobado por Real Orden el 7 de abril de 1850 [firma= Echevarria] [el ingeniero jefe= Ramón Ugarte]. (1858 abril 7)
2. Detalles de la marquesina para las estaciones de Alcalá de Henares y Guadalajara. Detalle de las basas de las columnas, elevación estructura metálica y cresterías de madera (A4 y 32 x 124 cm). (1860 junio -)
3. Planta y alzado de los abrigos de las estaciones de Alcalá de Henares y Guadalajara (A3). (1861 marzo 26)
4. Planta y alzado de la cochera de carruajes de la estación de de las estaciones de Alcalá de Henares (A3 y 31 x 84 cm). (1861 marzo 26)
5. Planta y alzados de los muelles cubiertos de las estaciones de Alcalá de Henares y Guadalajara (31 x 84 cm). (1861 marzo 26)
6. Detalles de los tornillos de las plataformas de Alcalá de Henares (A3). (1867 enero 19)
7. Planos del edificio de viajeros (30 x 63 cm), del abrigo (A3), la cochera de carruajes y del muelle de mercancías de la estación de Alcalá de Henares (A3). (s.f.)

1. Estación de Guadalajara. - Contiene: Memoria; Planos; Pliego de condiciones; Mediciones, cuadros de precios y presupuesto y oficios y minutas tramitando el proyecto. (1927 septiembre 20/1929 noviembre 14)
2. Estación de Azuqueca de Henares. - Contiene: Memoria; Planos; Pliego de condiciones; Mediciones, cuadros de precios y presupuesto y oficios y minutas tramitando el proyecto. (1927 septiembre 20/1928 diciembre 22)
3. Estación de Meco. - Contiene: Memoria; Planos; Pliego de condiciones; Mediciones, cuadros de precios y presupuesto y oficios y minutas tramitando el proyecto. (1927 septiembre 20/1928 octubre 22)
4. Estación de Alcalá de Henares. - Contiene: Memoria; Planos; Pliego de condiciones; mediciones, cuadros de precios y presupuesto y oficios y minutas tramitando el proyecto. (1927 septiembre 20/1928 septiembre 19)

1. Establecimiento de un paso particular aprobado por R.O. de 30 de abril de 1859. - Incluye: Plano parcelario de la línea, en el tramo de Alcalá de Henares (31 x 162 cm). (1858 agosto 19 / 1864 julio 16)
2. Solicitud del Conde de Canga Argüelles para establecer por su cuenta un paso a nivel y puerta en el km 33,610. (1862 abril 9 / 1876 noviembre 17)
3. Solicitud de Canuto Díez de Prado y Falcón para establecer un paso a nivel y poder pasar a su finca "El Encín", en el km 40,228. - Incluye: Perfil transversal del paso (Escala 1:100) (40 x 43 cm). (1864 mayo 12 / 1879 mayo 14)
4. Custodia por parte de guardabarreras y guardesas, durante la recolección, de los pasos a nivel de los km 32,332, 33,965 y 34,159. (1904 julio 4 / 1926 octubre 27)
5. Sustitución por un hombre de la mujer que guarda el paso a nivel del km 27,747, tras varios accidentes. (1919 marzo 7 / 1919 marzo 13)
6. Iluminación del paso a nivel del km 27,787 de la línea. - Incluye: Esquema de señal para el paso a nivel y postes de carriles (49 x 33 cm) y plano parcial de la carretera de Torrejón a Alcalá y la vía, en el que se señala el lugar donde deben ir instaladas las señales e iluminación del paso a nivel (Escala 1:500) (A3). (1927 diciembre - / 1930 febrero 5)
7. Colocación de barreras en el paso a nivel del km 34,159. (1929 octubre 3 / 1930 febrero 18)
8. Solicitud del diputado Rafael Esparza, para establecer un paso a nivel, en el km 33,058. - Incluye: Plano de la zona de Alcalá de Henares y localidades limítrofes (A3) y plano de la disposición de vías de la estación de Alcalá, en 1928. (1930 diciembre 21 / 1935 junio 26)

1. Plano general del proyecto de modificación del trazado entre Alcalá de Henares y Guadalajara (32 x 270 cm). (1856 noviembre 28)*
2. Perfil longitudinal de la sección de Guadalajara a Jadraque. (1860 diciembre 19)
3. Planos generales (2) de la estación de Alcalá de Henares. (s.f.)
4. Plano general de la estación de Meco y perfiles transversales (Escala 1/250) (30 x 84 cm). (1869 julio 3)*
5. Planos generales (2) de la estación de Guadalajara. (s.f.)
6. Plano de la distribución del edificio de viajeros de la estación de Guadalajara. (s.f.)
7. Plano general y perfiles transversales del apeadero de Fontanar. (1869 julio 3)
8. Plano del edificio de viajeros de la estación de Espinosa. (s.f.)
9. Plano general de la estación de Humanes. (1869 julio 3)
10. Planos generales de la estación de Jadraque. (1860 diciembre 31/1860 octubre 4)

Encuadernación en caja de conservación con anillas.

1. Nº 1-77 Ablates-Calasparra

1. Estación de Alcalá, obras para salida de humos e instalación de estufa. (1929 junio 1/1929 agosto 3)
2. Garita para aparato telefónico. (1929 junio 20/1929 agosto 22)
3. Autorización a Isidro Roldán para construir un cobertizo y cerca en un terreno lindante a los de la Compañía. (1929 julio 10/1929 agosto 22)
4. Denuncia a Bernardo García por ocupar terrenos de la Compañía en el km 34 de la línea. (1930 febrero 3/1931 abril 16)
5. Estación de Alcalá, modificación de la instalación eléctrica (1930 julio 11/1930 julio 10)
6. Estación de Alcalá, ampliación del muelle cubierto de Alcalá. (1930 agosto 1)
7. Reparación del suelo del almacén de gran velocidad. (1930 agosto 17)
8. Solicitud de Manuel Pastor Hernández para extraer gravas y arenas de la finca situada en el km 29 de la línea. (1931 febrero 21/1931 octubre 13)
9. Solicitud de Manuel Tebar para que se le agreguen tres habitaciones contiguas a su vivienda. (1931 julio 28/1931 agosto 13)
10. Derribo y reconstrucción de la tapia de cerramiento. (1932 mayo 17/1934 diciembre 10)
11. Autorización a Mariano Espada para extraer arena de una finca del km 32 de la línea. (1932 diciembre 12/1933 enero 2)
12. Solicitud de Luz Ibarra González para cercar la finca “El Ángel”. (1932 diciembre 19/1934 diciembre 8)
13. Cruce con línea de energía eléctrica de la Sociedad Eléctrica Castellana. (1933 julio 15/1935 enero 25)
14. Solicitud del ganadero Alfredo Bueno de un paso para ganado en el km 28.100 de la línea. (1933 diciembre 4/1933 noviembre 24)
15. Cruce con colector para desagüe en el km 34.158 de la línea. (1934 febrero 9/1935 agosto 20)
16. Traslado al km 34.250 del cruce telefónico del Centro de Transmisiones Militares. (1935 febrero 15/1935 abril 26)
17. Autorización a Juan G. Yarritu para cercar una finca lindante con terrenos de la Compañía. (1935 marzo 4/1935 marzo 13)
18. Solicitud de Victoria Riofrío para que se le conceda un quiosco. (1935 mayo 17/1935 mayo 37)
19. Cruce en el km 34.168 con tubería de agua del Ayuntamiento. (1935 diciembre 17/1936 febrero 8)
20. Instalación de teléfono en el km 34,159 cruce con la carretera de Alcalá - Meco. (1936 enero 20/1937 marzo 26)
21. Instalación de teléfono en la casilla del km 27,788 en el cruce con la Carretera General de Francia. [A2]. (1936 noviembre 12/1936 diciembre 14)
22. Excavaciones bajo la explanación del km 34.617 de la línea. (1937 abril 7/1937 abril 12)
23. Cruce con tubería de agua del Instituto Psiquiátrico de Alcalá, en el km 35.803 de la línea. (1937 agosto 6/1937 septiembre 27)
24. Cruce en el km 32.331 con registro telefónico del Grupo de Protección de Vuelo, de las fuerzas aéreas. (1937 agosto 31/1937 septiembre 30)
25. Cruce de tubos y línea telefónica del “Grupo de Protección de Vuelo”, de las Fuerzas Aéreas en el km 36,800 de la línea. (1937 septiembre 37/1937 octubre 5)